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单细胞测序技术揭示人鼠早期胚胎发育基因程序


研究背景


     哺乳动物早期胚胎发育是一个复杂的过程涉及到转录层面架构的巨大变化。在此,我们使用单细胞测序技术对人和鼠从卵母细胞桑葚胚期到进行了深入的转录组动态变化分析。



研究方法





研究结果



1 a:无监督层次聚类图;b:不同阶段基因表达量主成分分析;c:单细胞胚胎与桑椹胚的相关性分析;d:单细胞期激活79个基因在各个时期的表达量聚类热图。






2 a:WGCNA分析各模块层次聚类图;b:热图展示7313个基因在7个阶段的表达量热图。





3 a:不同数据获得的各个阶段保守得分热图;b:人与鼠各模块间的相关性。




研究结论


    本研究说明,单细胞测序技术可有效提高人胚胎细胞转录组定量水平。研究极大的扩展了我们对人类早期胚胎转录组架构、基因激活顺序、遗传编程的认识。多物种研究揭示了人早期胚胎发育的转录机制是高度保守的,是一种进化上的保守分子过程,包括一些关键基因的驱动。通过共表达模块分析也看到了人跟鼠的一些不同。




参考文献



Genetic programs in human and mouse early embryos revealed by single-cell RNA sequencing. [Nature, 2013]



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