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经典案例

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案例1 circRNA在外泌体中广泛而稳定的存在,可作为潜在的癌症诊断标志物


研究背景



       近些年来发现circRNA是一种广泛分布的内源性非编码RNA,能够调控基因表达。circRNA具有细胞、组织甚至发育阶段特异性。外泌体中存在着很多蛋白质,mRNA,microRNA,这些物质调控着细胞的行为,可能会作为疾病诊断标志物。而外泌体中的circRNA却没有被报道过。本研究首次通过circRNA测序鉴定外泌体中的circRNA种类。



研究方法





研究结果



1 细胞与细胞外泌体中的circRNA。



2 人血液外泌体circRNA在基因组上的分布。



研究结论


      本研究揭示了外泌体中的一类新的RNA分子circRNA,并且发现癌症病人血清中的外泌体circRNA与正常人的外泌体circRNA显著不同,可能会成为一类有效的癌症诊断标志物。





案例2  circRNA是一大类具有调控潜能的RNA分子


研究背景



    circRNA是一类较为神秘的尚未弄清功能的RNA分子,为了系统的研究circRNA,本研究对人、小鼠和线虫进行了测序。



研究方法




研究结果



lncRNA个体间表达差异聚类热图。a:circRNA鉴定原理图;b,c:人多个类型细胞中circRNA的数量;d:circRNA在基因组上的分布。







研究结论


       需要更全面的对这些低表达和高组织特异性的lncRNA进行注释。同时,当我们对人类的lncRNA进行深入的注释或者将其用于预后或疾病的标志物时,也要考虑到个体之间lncRNA表达的差异。本研究鉴定了大量的表达良好,稳定存在,同时具有组织和发育阶段特异性的circRNA。另外,发现了一种来源于CDR1as基因的circRNA,具备强力吸附miR-7的能力,显示出circRNA能够通过调节miRNA的表达量调节基因的功能。



参考文献


    1、Circular RNA is enriched and stable in exosomes: a promising biomarker for cancer diagnosis. [Cell Research, 2015]
    2、Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency. [Nature, 2013]



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